ՀՀ ԳԱԱ Տեղեկագիր: Ֆիզիկա = Proceedings of the NAS RA: Physics

Обобщенная модель полипептидной цепи при наличии ограничения на длину спирального участка

Тоноян, Ш. А. and Айрапетян, Г. Н. and Царукян, А. В. and Мамасахлисов, Е. Ш. and Морозов, В. Ф. (2008) Обобщенная модель полипептидной цепи при наличии ограничения на длину спирального участка. ՀՀ ԳԱԱ Տեղեկագիր. Ֆիզիկա, 43 (4). pp. 311-318. ISSN 0002-3035

[img]
Preview
PDF
Download (220Kb) | Preview

    Abstract

    Предложена модель с гамильтонианом, состоящим из двух слагаемых, соответствующих гамильтонианам Обобщенной Модели Полипептидной Цепи (ОМПЦ), с различными масштабами взаимодействия. Рассмотрен случай, когда крупномасштабное взаимодействие соответствует отталкиванию, в то время, когда мелкомасштабное взаимодействие соответствует притяжению, что моделирует плавление системы в условиях компактной упаковки (глобуля- ризованный полипептид или ДНК в капсиде). Առաջարկված է մոդել՝ երկու գումարելիներից կազմված համիլտոնյանով, որոնք համապատասխանում են փոխազդեցության տարբեր մասշտաբներով ՊՇԸՄ համիլտոնյաններին։ Դիտարկված է դեպք, երբ մեծամասշտաբ փոխազդեցությունները համապատասխանում են վանողությանը, մինչդեռ փոքրամասշտաբ փոխազդեցությունները համապատասխանում են ձգողությանը, ինչը համապատասխանում է համակարգի հալմանը կոմպակտ փաթեթավորման պայմաններում (գլոբուլացված պոլիպեպտիդ կամ ԴՆԹ կապսիդում): A model with the Hamiltonian which consists of two parts corresponding to the Hamiltonian of GMPC with different scales of interaction is proposed. The case when long-scale interactions correspond to attraction is considered while short-scale interactions correspond to repulsion. This corresponds to the system melting in compact packing (globulized polypeptide or DNA in capsid).

    Item Type: Article
    Additional Information: Պոլիպեպտիդային շղթայի ընդհանրացված մոդելը պարուրային տեղամասի երկարության վրա սահմանափակման առկայության դեպքում։ Generalized model of polypeptide chain with limitations on the length of helical fractions.
    Uncontrolled Keywords: Տոնոյան Շ. Ա., Հայրապետյան Գ. Ն., , Ծառուկյան Ա. Վ., Մամասախլիսով Ե. Շ., Մորոզով Վ. Ֆ., Tonoyan Sh. A., Hayrapetyan G. N., Tsarukyan A. V., Mamasakhlisov Y. Sh., Morozov V. F.
    Subjects: Q Science > QC Physics > Chemical Physics
    Divisions: UNSPECIFIED
    Depositing User: Professor Vladimir Aroutiounian
    Date Deposited: 07 Jun 2012 15:55
    Last Modified: 02 Apr 2014 17:31
    URI: http://physics.asj-oa.am/id/eprint/782

    Actions (login required)

    View Item